张文亮，博士，教授，博士后合作导师，“南山学者”高层次人才。
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张文亮，博士，毕业于中山大学，现任广州医科大学生科院教授, 博士后合作导师，“南山学者”高层次人才，广东省生物信息学会理事会副秘书长, 理事，中国人工智能学会生物信息学与人工生命专委会委员, 中国计算机学会生物信息学专委会, 人工智能与模式识别专业委员会和大数据专业委员会委员，广东省生物化学与分子生物学学会青年委员，广东高校科技成果转化中心专家库专家和浙江温州市科技局专家库专家等。带领团队长期从事肝癌等人类重大疾病多组学数据挖掘与人工智能研究以及致病机制研究，已独立主持国自然/省部级等各级项目5项，获授权/受理国家第1发明人专利5项，以第1/通讯（含共同）作者在 J Exp Clin Cancer Res (2025), Knowledge-Based Systems (2025), Bioinformatics (2024), Nucleic Acids Res (2022a，2022b), Brief Bioinform (2019), GPB (2020)等国际知名SCI期刊发表系列论文成果，相关成果多次受邀在国内外学术大会做报告，产生了较广泛的国际影响。此外，还兼任iMeta等SCI期刊青年编委和20余本国际期刊特邀审稿人。本课题组常年招收生物医学和生物信息学等研究方向的博士后, 研究生和科研助理职位，欢迎有挑战精神的科研人员通过邮箱投简历，应聘加盟我们团队。课题组网址：http://www.biomedical-web.com/omicslab/Home.html。
教育经历
2009.09 - 2013.06 江西农业大学 生物工程 学士
2013.08 - 2016.06 中山大学 生物化学与分子生物学 硕士
2017.08 - 2020.06 中山大学 遗传学 博士
工作经历
2016.07 - 2017.05 深圳华大基因股份有限公司 遗传分析工程师
2020.08 - 2022.08 香港大学深圳医院 / 中科院深圳先进技术研究院 博士后助理研究员（联合培养）
2022.09 - 至今 广州医科大学生命科学学院 生物技术系 教授
教学经历及成果
2022.9 –至今，讲授《生物信息学》和《组学技术与应用》等课程。
研究方向：
1.肝癌等恶性肿瘤的单细胞空间多组学数据挖掘研究；
2.非经典开放阅读框编码微蛋白调控肝癌等恶性肿瘤发展的机制研究；
3.大语言模型驱动的疾病多组学数据挖掘系统平台研发；
荣誉奖励
1. 2022年广州医科大学高水平大学建设“南山学者”骨干人才；
2. 2021年第十届全国生物信息学与系统生物学学术大会优秀墙报一等奖；
主持项目
1. 广州医科大学高水平大学建设南山学者骨干人才启动经费，2022.09-2027.09，主持，在研；
2. 国家自然科学基金（青年项目），2022.01-2024.12，主持，已结题；
3. 广东省基础与应用基础研究基金，2020.09-2023.09，主持，已结题；
4. 中国博士后科学基金，2021.06-2022.05，主持，已顺利结题；
5. 香港大学深圳医院博士启动基金，2020.10-2022.07，主持，已结题；
部分代表性论文
# 共同第一作者; * 通讯作者
1. Lei Zhao#, Ke Si#, Shenjian Luo#, Lantian Zhang, Shuai Mao, Wenliang Zhang*. (2025).Non-canonical activation of MAPK signaling by the lncRNA ASH1L-AS1-encoded microprotein APPLE through inhibition of PP1/PP2A-mediated ERK1/2 dephosphorylation in hepatocellular carcinoma. J Exp Clin Cancer Res;44(1):200.
2. Haipeng Zhu#, Guoying Wang#, Zhihong Liao, Wenliang Zhang*. (2025). AITL-Net: An adaptive interpretable transfer learning network with robust generalization for liver cancer recognition. Knowledge-Based Systems; 318: 113473
3. Douyue Li#, Zhuochao Min#, Jia Guo#, Yubin Chen, Wenliang Zhang*. (2024). ExpOmics: a comprehensive web platform empowering biologists with robust multi-omics data analysis capabilities, Bioinformatics;40(8):btae507.
4. Yang Liu#, Zhuochao Min#, Jing Mo #, Zhen Ju, Jianliang Chen, Lantian Zhang, Weiling Liang, Hanguang Li, Godfrey Chi-Fung Chan*, Yanjie Wei*, and Wenliang Zhang*. (2024). ExomiRHub: a comprehensive database platform to integrate and analyze human extracellular miRNA transcriptome for discovering non-invasive biomarkers, Computational and Structural Biotechnology Journal; 23:3104-3116.
5. Likang Zhang#, Jiahui Sun#, Sheng Liu, Wenliang Zhang*, and Jianlong Zou*. (2023). 3D culture of the spinal cord with roots as an ex vivo model for comparative studies of motor and sensory nerve regeneration, Experimental Neurology, 362:114322.
6. Wenliang Zhang#*, Yan Zhang#, Zhuochao Min#, Guodong Liang, Jing Mo, Zhen Ju, Binghui Zeng, Wen Guan, Yan Zhang, Jianliang Chen, Qianshen Zhang, Hanguang Li, Chunxia Zeng,Yanjie Wei*, and Godfrey Chi-Fung Chan*. (2022). COVID19db: a comprehensive database platform to discover potential drugs and targets of COVID-19 at whole transcriptomic scale, Nucleic Acids Research, 50(D1),D747-D757
7. Wenliang Zhang#*, Yang Liu#, Zhuochao Min#, Jing Mo, Zhen Ju, Wen Guan, Binghui Zeng, Yang Liu, Jianliang Chen, Qianshen Zhang, Hanguang Li, Chunxia Zeng, Yanjie Wei*, and Godfrey Chi-Fung Chan*. (2022). circMine: a comprehensive database to integrate, analyze and visualize human disease related circRNA transcriptome, Nucleic Acids Research, 50(D1),D83-D92
8. Wenliang Zhang, Haiyue Zhang, Huan Yang, Miaoxin Li, Zhi Xie and Weizhong Li*. (2019). Computational resources associating diseases with genotypes, phenotypes and exposures, Briefings in Bioinformatics,20(6),2098-2115
9. Wenliang Zhang#*,Binghui Zeng#, Huancai Lin,Wen Guan,Jing Mo,Yanjie Wei,Qianshen Zhang,Dongsheng Yu*, Weizhong Li*&Godfrey Chi-FungChan*. (2021).CanImmunother:a manually curated database for identification of cancer immunotherapies associating with biomarkers,targets, and clinical effects, OncoImmunology,10(1),1944553
10. Wenliang Zhang#, Binghui Zeng#, Minglei Yang, Huan Yang, Jianbo Wang, Yongjie Deng, Guocai Yao, Song Wu, Haiyue Zhang and Weizhong Li *. (2021). ncRNAVar: a manually curated database for identification and validation of noncoding RNA variants associated with human diseases, Journal of Molecular Biology, 433(11):166727.
11. Guocai Yao#, Wenliang Zhang#, Minglei Yang, Huan Yang, Jianbo Wang, Haiyue Zhang, Lai Wei, Zhi Xie and Weizhong Li*. (2020). MicroPhenoDB associates etagenomic data with pathogenic microbes, microbial core genes and human disease phenotypes, Genomics, Proteomics & Bioinformatics,18(6),760-772
12. Wenliang Zhang, Guocai Yao, Jianbo Wang, Minglei Yang, Jing Wang, Haiyue Zhang, Weizhong Li*. (2020). ncRPheno: a comprehensive database platform for identification and validation of disease related noncoding RNAs, RNA Biology, 17:7, 943-955
13. Wenliang Zhang#, Shaoyang Zhang#, Wen Guan#, Zhicong Huang, Jianqiu Kong, Chunlong Huang, Shulan Yang*, Haihe Wang*. (2020). Poly C binding protein 1 regulates p62/SQSTM1 mRNA stability and autophagic degradation to repress tumor progression, Frontiers in Genetics, 14;11:930.
14. Wenliang Zhang#, Shi Hongshun#, Zhang Mingming, Liu Bin, Mao Shuai, Li Li, Tong Fang, Liu Guoliang, Yang Shulan, and Wang Haihe*. (2016). Poly C binding protein 1 represses autophagy through downregulation of LC3B to promote tumor cell apoptosis in starvation, International Journal of Biochemistry and Cell Biology, 73:127-136.
申请专利
1.张文亮; 司珂; 高通量解析非经典开放阅读框编码能力与功能的文库设计及分析方法, 2025-3-4, 中国, 2025102503249 (专利)；
2.张文亮; 江泽航; 一种可变多聚腺苷酸化动态分析方法和装置, 2025-1-14, 中国, 2025100528063 (专利)；
3.张文亮; 江泽航; 陈育彬; 一种用于分析空间转录组数据的方法及系统, 2025-1-15, 中国, 2025100599872 (专利)；
4.张文亮; 一种ncRNA基因突变的解读方法, 存储介质及终端, 2023-6-2, 中国,
2023106532769 (专利)；
社会任职/学术任职
1.2025.1 - 至今，《Precision Clinical Medicine》期刊青年编委；
2.2024.12 - 至今，《Interdisciplinary Sciences Computational Life Sciences》 期刊青年编委；
3.2024.7 - 至今， 中国人工智能学会生物信息学与人工生命专委会委员；
4.2023.5 - 至今，广东省生物信息学会理事会副秘书长, 理事；
5.2023.8 - 至今，中国计算机学会生物信息学专业委员会委员；
6.2023.6 - 至今，中国计算机学会人工智能与模式识别专业委员会委员；
7.2023.6 - 至今，中国计算机学会大数据专业委员会委员；
8.2023.4 - 至今，广东省生物化学与分子生物学学会青年委员；
9.2023.5 - 至今，广东高校科技成果转化中心专家库专家；
10.2022.7 - 至今，亚太人工智能协会成员；
受邀参加/组织的国内外学术会议
1.2025.5，参与组织承办第六届广东省生物信息学会年会暨粤港澳大湾区生物信息学学术大会；
2.2025.3，于深圳参加第二届全国基因组信息学大会；
3.2024.10，于海口参加第十三届全国生物信息学与系统生物学学术大会；
4.2024.6，于桂林参加中国人工智能学会生物信息学与人工生命专业委员会生物信息学与智能信息处理2024年学术会议；
5.2024.4，于广州参加第五届广东省生物信息学会年会暨广东省生物信息学高峰论坛；
6.2023.8，于乌鲁木齐参加第八届中国计算机学会生物信息学会议；
7. 2023.7，于上海参加金砖国家信息通信技术和高性能计算工作组第七次会议；
8. 2023.5，于广州参加2023年广东省生物信息学会年会及高峰论坛，并作会议口头报告；
9. 2021.10, 于成都参加第十届全国生物信息学与系统生物学学术大会, 并做研究成果壁报展示；
10. 2018.04, 于上海参加第 11 届国际审编大会(2018 Biocuration), 并做研究成果壁报展示；
11. 2018.10, 于澳门参加第八届全国生物信息学与系统生物学学术大会, 并做研究成果口头汇报；
12. 2017.10, 于长沙参加第二届中国计算机学会生物信息学会议, 并做研究成果壁报展示。